将邪恶组织九头蛇利用基因操作创造出来的少年战士们拯救出来的复仇者联盟。拥有超人能力，却尚未成熟的少年们以“未来复仇者联盟”之身份成为他们的弟子，并开始锻炼自身。

“我们该如何定义‘人’？”本剧制作阵容强大，由安达宽高（乙一）出任编剧，天野喜孝担纲角色设计，坂本龙一配乐，佐藤雄三执导，携手打造全新原创太空恐怖科幻故事！　　在遥远的未来，人类被迫离开地球，移民到另一个星系。一支先遣队奉命出发，寻找适合居住的星球。所有星舰成员都是以生物 3D 打印的方式一一制造，没想到过程中机器意外故障，导致其中一位成员路易变成畸形。随着路易接连攻击同僚妮娜、麦克、帕蒂和奥斯卡，星舰也陷入黑暗骇人的境地，任务结束的倒数计时正式开始。

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　　在计算机宅男阿学遭到混混纠缠时，出手救了他的是隔壁班素昧平生的阿阳。脑子动得快、八面玲珑、做坏事却不懂得踩剎车的阿阳，与有着沟通障碍、计算机知识却非常丰富的阿学，两人就此结下不解之缘，成为互补的最强搭档。毕业后，两人决定白手起家创业，一起赚到能买到世界上任何想要东西的「一兆美元」！为此，他们决定挑战世界级黑客大赛SECCHAM……！

　　此去经年，窟卢塔族惨遭灭族的伤痛依然时时折磨着最后的遗民酷拉皮卡（泽城美雪 配音）的身心。在追寻幻影旅团的旅途中，酷拉皮卡竟意外重逢当年的本族好友Bairo，谁知却被对方夺去了号称“七大美色”之一的绯红之眼。他的遭遇经雷欧力之口，很快传到了奇犽（伊濑茉莉也 配音）和小杰（潘惠美 配音）的耳中。为了找到伤害朋友的真正凶手，他们四处追查对方的藏身之地，在这一过程中结识了美丽神秘的少女小列，同时遭到一群死亡人偶的攻击。另一方面，西索（浪川大辅 配音）突然现身酷拉皮卡和雷欧力面前，向他们揭示了凶手的真实身份。盘根错节的恩怨，拉开了一场惨烈战斗的序幕…… 　　本片根据漫画家富樫义博的同名原作改编，为该动画的首部剧场版。