TV系列的幕后黑手托雷基亚败给了泰迦奥特曼，被封印在托雷基亚体内的邪神魔兽格里姆德借机从托雷基亚体内逃出。\r\n托雷基亚设计引来了泰迦的父亲泰罗奥特曼，最终托雷基亚阴谋得逞，还让泰罗坠入了黑暗。\r\n恶人协会的人似乎盯上了伊吉斯的优幸，新生代的奥特战士们纷纷赶来地球，前来帮忙。一场世纪大战一触即发。

地球上住着很多偷偷隐居在此的宇宙人。只有很少一部分的人知道这个真相，一般民众并不知情。 在这样的社会中主人公 “工藤优幸”就职于以解决宇宙人所产生的纠纷为主的民间警备组织“伊吉斯”每天为了和平而努力工作着。 而他身上却隐藏着连自己都不知道的秘密，那就是附在其身上的泰迦奥特曼的光之粒子，泰迦奥特曼在优幸体内苏醒的那一刻，新的故事开始了。

主人公朝仓陆有一天入手了了捷德升华器与奥特胶囊，得到了变身成捷德奥特曼的力量。与此同时也知道自己继承了堕入邪恶的黑暗巨人贝利亚奥特曼的遗传基因。自己作为在地球长大的普通年轻人，知道了自己其实是贝利亚的儿子。捷德奥特曼，也就是朝仓陆的命运发生了巨大变化。

在父亲经营的小卖店工作的凑活海与大学生的凑勇海两兄弟与妹妹和父亲一同生活在一起，2人突然与在城市中出现的未知巨大生物（怪兽）遭遇！某日，兄弟二人获得了罗布回旋闪光和罗布水晶；以罗布回旋闪光及罗布水晶的力量2人奥特曼变身！ 罗索奥特曼＆布鲁奥特曼的战斗从此开始！

世界上发生大规模地球人消失事件，进次郎和玲奈也同时消失了。消失的进次郎和玲奈被传送到了位于卫星轨道的外星人飞船上。 自由记者光太郎因为调查“消失事件”之谜知晓了太多真相，后来惨遭灭口。但有人不希望光太郎就这样死去，于是复活了光太郎。复活后的光太郎变成了超人。 外星人恐怖组织“黑暗之星”向世界发出了声明。他们以人质为要挟，要求获得地球的公民权。科特队为了救出人质，与“黑暗之星”的外星人展开了激烈的战斗。佐菲、杰克、艾斯也赶来帮助科特队解救人质。这一次奥特六兄弟，全员到齐！ 金古桥降临在涩谷大肆破坏城市。进次郎为了救出所有人质，他团结起大家的力量，众人齐心协力打败了金古桥。金古桥内部的人质也都全部成功获救。

传说在芭罗慈遗迹中封印着太古时代的地狱。 然而对文物古迹有着强烈好奇心的黑崎硬是解开了该封印！随后，能将世界化为地狱的阎魔兽赛高古复活了！ 赛高古实力超群，在它强力的攻击下，艾克斯奥特曼的光芒消失了。地球会就此迎来末日吗？ 为了阻止赛高古，吉奥的队员们和考古学家玉城司教授抱着必死的决心前去寻回能封印赛高古的神秘之力。 在千钧一发之际，玉城司的儿子悠斗那想要保护母亲的强烈愿望引发了奇迹。 初代奥特曼、迪迦奥特曼就此登场！ 随后，吉奥与奥特英雄们合力对付以赛高古为首的怪兽军团，激战就此展开。

和平的岁月稍纵即逝，在银河奥特曼与维克特利奥特曼击败维克特路基艾尔的一年后，神秘的时空城突然在地球上空出现。超时空魔神艾塔尔加和异世界女战士阿蕾娜夸下海口，要用手中的魔镜封印所有的奥特战士。而此时，迪迦奥特曼、戴拿奥特曼、盖亚奥特曼、高斯奥特曼、奈克赛斯奥特曼、麦克斯奥特曼、梦比优斯奥特曼等都被封印在了时空城里。礼堂光及其所在的特搜队UPG的队友们如临大敌，和前所未有的敌人陷入了苦战。在战斗进入紧张之际，来自另一个宇宙的青年春野武藏和赛罗奥特曼加入进来。战斗进入白热化阶段，邪恶势力终将面对全员十名奥特曼捍卫正义与和平的时刻。而作为战斗主力的小光以及翔能否将银河与维克特利的力量融合在一起呢？

20年前，奥特兄弟为了阻止由异次元人亚布鲁怨念衍生出来的终极超兽奥特杀手萨乌鲁斯，奥特兄弟用尽了所有力量和萨乌鲁斯进行了一番苦战。最后，奥特杀手萨乌鲁斯被打败，沉入了神户港的深海。亚布鲁的怨念得以被封印，但是，奥特兄弟们也丧失了变身的能力。 梦比优斯奥特曼来到地球半年后，隐约感觉到了神户的异样并独自一人去前去调查。梦比优斯奥特曼得知传说中的奥特兄弟作为人类，在神户生活着。此时，由多位外星人组成的宇宙联盟为了解开当年封印，也来到了地球。为了使沉睡在神户深海的奥特杀手萨乌鲁斯复活，宇宙联盟决定先铲除可能成为最大阻碍的梦比优斯奥特曼。光之国的佐菲向地球上的奥特兄弟们发出了奥特签名，提醒他们要小心宇宙联盟。 一场正邪之间的较量再度展开......