饭冢和人一位平凡的14岁中学生，有天，在回家的途中遭到外星忍者攻击，危急之下七瀬成恵出现救了他一命，拿着球棒把外星忍者打跑的可爱成惠，和人瞬间对她一见钟情。在好友丸尾正树的鼓励下，和人鼓起勇气约成惠出来喝茶当面谢谢她，成惠一开始有点抗拒，并且表明自己是位外星人，和人对此表示不在乎，很快地，他们就成为一对男女朋友了。

拥有用肉眼看见“菌”能力的少年泽木直保和青梅竹马结城萤进入农业大学所发生一连串的趣事，透过直保和其他人物的互动可以了解许多跟菌相关的知识，也因为直保的特殊能力而招惹许多事情…… 在每集动画中的片尾都有“菌剧场”。

【本字幕由诸神双语字幕组协力译制】在20世纪,世界格局比较稳定的时候,各大国都想增强自己的军事力量,从而称霸世界.而Whisper[耳语者]这种特殊的人类,自从出生开始就拥有特殊的能力,不用学习也能知道超越当时科技几十年的被称为黑科技的高科技手段.为了保护世界格局的稳定,神秘组织Mithril[米斯利尔]派出了相良中士等三人去保护一名已知的Whisper[耳语者],即千鸟要。其中相良中士装成转校生随时跟踪保护,由于长期处于军队的生活,完全没有普通高中生的生活常识的相良中士在学校里闹了不少笑话.在学校期间也发生了不少恐怖的事情,如苏联为绑架香奈制造的劫机事件等.宗介和千鸟之间也因为发生的各种事件产生了特殊的感情.

打倒了敌人“汞合金”的九龙、盖茨等强敌，恢复了以往和平日常的“阵代高中”。但，这样的日子并未延续多久……。持续失态的“汞合金”开始正式向相良宗介等人发动袭击。世界各地的“秘银”基地遭到强袭！泰莎率领的Tuatha de Danaan所容身的“美利达岛”也遭到大量导弹、强袭机兵的攻击。另一方面，魔手也正在逼近日本的宗介与要！！宗介、要、泰莎等人，再度面临试炼！！！

所谓的“除妖”，即是把由于某些缘由而从原本应在的“隐世”来到“现世”停留的妖怪们送回“隐世”这一工作。某天，被妖怪附体的高中生·芦屋花绘，依靠偶然发现的联络方式，来到了除妖的店“物怪庵”。在那里的是一脸不高兴的店主·安倍晴斋。由于某些缘故，芦屋就这样以物怪庵奉公人的身份开始工作……。安倍与芦屋的除妖组合和妖怪们的物语就此开幕。

　　座落某个小镇的兔子商店街上，有一间日式饼店，住着一位十分喜欢饼类小吃的高中一年级女生——玉子。除了偶尔在店铺协助父亲，以及钻研新口味的饼类小吃外，她亦有跟学校的朋友参与羽毛球部活动。而饼店对面是同行的竞争对手，两边的父亲经常都因生意问题而喧哗。不过对方儿子——饼藏却自小跟玉子建立青梅竹马的关系，近日更不断隐约地表达心思，只是玉子没有特别注意，更常常被旁观的朋友拿出来扰攘一番。总而言之，玉子就是在商店街众人的护荫下，如此热闹地渡过每一天，生活可谓过得相当快乐。 　　除夕，也就是玉子的生日，处于商店街年末最繁忙的时刻。庆祝仪式已经成为了商店街上下的惯例，唯独今年的饼藏没有准时来到。直到他带着礼物来到之时……一只光辉灿烂的鸟出现在众人面前。偶然变得越来越热闹的兔子商店街，亦正式开始其稍微不同的新一年。

　　21世纪人类开始开发宇宙。但是受到宇宙生物群（通称宇宙怪兽，STMC）：一种以恒星作载体繁殖的生物来袭，使人类文明受到重大威胁。为了对抗宇宙怪兽，人类持续开发机器人兵器和宇宙战舰，由地球上的机器人训练学校找出优胜的驾驶员控制。 　　2015年，在人类史上第一次和宇宙怪兽接触后，故事的女主角高屋法子进入了机器人训练学校接受训练，驾驶对抗宇宙怪兽最强武器：Gunbuster，开始了她守护地球使命的故事。

「僕が愛したすべての君へ」では、母親と暮らす高校生の高崎暦がクラスメイトの瀧川和音から声を掛けられたことをきっかけにストーリーが展開。85番目の並行世界から移動してきたという彼女は、その世界では2人が恋人同士であると告げるのだった。

人们会经常地变动于仅有些许差别的平行世界，这点在这个世界已被证明—— 　　因为两亲离婚而和父亲住在一起的日高历，在父亲任职的虚质科学研究所里与名为佐籐栞相遇了。 　　互相抱有淡淡恋心的两人，在某天因为父母的再婚问题而大大改变。 　　认为已经无法和对方结婚的历和栞，决定跳跃到不会成为兄妹的世界…… 　　她不在的世界毫无意义。