距今超过六千年的远古世界，天地割裂的凄惨战争持续不断，毫无还手之力的人类被拥有强大力量的各个种族逼入绝境，濒临灭亡。此时率领人类的年轻领袖里克，与机凯种少女休比偶然相遇。被同伴抛弃的休比，为了修复故障，拜托里克把“人类的心”告诉自己。机凯种少女的单纯与真诚，使得里克对休比逐渐放下戒备、敞开心扉，二人感情亦日渐升温。最终二人带领人类共同面对终极一战，少女休比也将面临恋人与生命的残酷抉择。末日来临，在251秒的时间里，赌上一场深情告白。

　　痛觉残留：经历了和职业炸弹狂魔仓密目琉夏的惨烈对决后，伤痕累累的两仪式（坂本真绫 配音）待在家中静养。适逢黑桐干也（铃村健一 配音）需外出公干，他自顾自将一只黑猫托付给两仪照看。两仪与黑猫的关系巧巧起了变化；俯瞰风景：礼园女子学院八名女孩自杀，宫月理理栖（种田梨沙 配音）凭吊自杀的好友安藤由子，后悔自己没有和她一同赴死。就在此时，业已失明的浅上藤乃（能登麻美子 配音）出现在宫月面前；新年参拜：1998年即将过去，干也和两仪并肩走在去神社参拜的路上。寒冷的冬夜，两颗孤独之心不知不觉越来越近。 　　本片根据武内崇创作绘制的三个短篇漫画改编。

　　1999年1月，黑桐鲜花所就读的高级女子中学——礼园出现了神秘的事件。一年四班的学生橘佳织在宿舍起火事件中身亡，随后，一年四班全体同学的生活改变了。每天活在痛苦与烦恼中的她们，收到了不明来源的信件。不安的情绪在礼园全体学生间蔓延。为了解决事件，两仪式假扮学生潜入礼园，与黑桐鲜花一同调查事件的原委。另一方面，黑桐干也在使用自己的方法追踪事件的真相。而事件的背后，似乎还有那个男人，魔术师荒耶宗莲的安排。 　　苍崎橙子之徒黑桐鲜花，拥有“直死之魔眼”的两仪式，魔术与战斗的交叉，礼园的秘密在她们面前展开。 　　日本同人小说最高境界《空之境界》全七章动画化，本作为第六章电影版。

　　三年前太空飞船猎户号坠毁学园都市，由此引发了严重的惨剧，而该事件也促成宇宙电梯恩底弥翁（Endymion）的建设。在恩底弥翁接近完工的前夕，上条当麻（阿部敦 配音）和茵蒂克丝（井口裕香 配音）揭示了热爱歌唱的少女鸣护亚丽莎。心怀梦想的亚丽莎经过不断的修业和努力，终于得到了试镜的机会，并有可能在恩底弥翁落成的庆祝活动中演唱。这一晚，当麻、茵蒂克丝和亚丽莎在夜归途中遭到史提尔率领的魔法师们的攻击。而学园都市秩序维持部队的介入，无疑标志着魔法侧和科学侧全面战争即将爆发。亚丽莎的体内究竟隐藏着怎样的力量和秘密…… 　　本片根据镰池和马（创作）、灰村清孝（插画）的轻小说改编。