林云飞在处理一起普通的盗窃案时，发现异常，迅速报告了八所处长洪子城。洪处长意识到这很可能是一件间谍案，决定接手此案。在对八所的有关人员进行甄别排查时，发现张铨有重大嫌疑，就在将要对其进行询问时，张铨突然被杀。与此同时，上级通报，失窃情报可能在48小时内通过卫星自动发射。时间一分一秒地过去，案件毫无进展。 就在失窃情报即将自动发射的关键时刻，林云飞运用特殊的侦察手段，使代号“无面人”的境外间谍分子不得不低头认罪，外线侦察员也成功地截获了失窃情报。正当大家庆贺胜利时，又传来国家航天重点科研机构——动力所的重要科研计划已经被泄露到了境外的消息。 在案情分析会上，关厅长带来了年轻女侦察员石慧，并宣布她为侦察科新科长，负责专案组的侦破工作。这让两个铆着劲的副科长林云飞和董智超很不解。为了便于侦破此案，处里决定派林云飞以动力所办公室副主任的身份进入动力所，进行跟踪侦察。并对动力所进行了一次全面的安全检查，不想发现火箭燃料K1样品少了。林云飞非常自责在自己眼皮底下K1样品丢失，回想在动力所的每个细节，一个重要人物也出现在自己的眼前。经过严密的侦察、分析，证实了林云飞的想法，是动力所工程师袁知方监守自盗，其背后一个代号为“戴安娜”的境外间谍小组浮出水面。 随着侦察的进一步深入，一个神秘女人出现在侦察员的视线内。此人就是与林云飞有过交往的TTC公司董事长金梦。金梦对林云飞有“副省长”亲戚的特殊背景很感兴趣，正力请林云飞到TTC公司工作。石慧建议趁此机会，派林云飞打入TTC公司，近敌侦察。 境外间谍组织指示金梦对林云飞进行了严密的考察，在石慧等侦察员的密切配合下，林云飞逐个化解了一次又一次的危机，也逐渐取得了金梦对自己的信任，只是负责组织安全的王跃龙对林云飞仍不放心。正当林云飞在TTC公司逐渐顺利展开工作时，动力所的火箭燃料样品K2配方又被窃取了。 种种迹象表明，在八所和动力所发生的一系列案件，只是境外间谍组织此次行动的序曲，更大的阴谋正悄悄地展开。

2005年春，一个号称投资上亿，名为HRD的医药项目将落户蓝海。蓝海市两家龙头企业，南华制药和东森制药展开了激烈的竞争。南华的老板郭林打算在这次的竞争中一举击败东森的老板李小军，以了结双方多年来的宿怨。恰在此时，人称“贼公子”的熊伟为报父仇，潜入了郭林家，试图寻找置郭林于死地的证据，结果却意外碰上郭林的妻子方华和郭林的司机刘成仁偷情。熊伟从保险柜里拿走了一个U盘和部分现金。未曾想，他的这一举动成了引发蓝海市血雨腥风的导火线。不久刘成仁被人追杀，手指被砍掉，南华发生了爆炸，郭林心腹廖主任受伤。刑警队长刘建平意识到自己已经置身一场生死博弈之中。在随后的行动中，由于刘建平大意，导致了老搭档胡文成的牺牲，而嫌疑人柳东的身亡更令他感觉自己成了别人棋盘上的一粒棋子。 【演员】 于和伟,姜超,斌子,谢沅江,石兰

在高华大学变异的经历总在重演，关于军方通缉的亦围绕在脑海，科学家Bruce Banner就在这样的梦魇下在巴西一边控制着体内的伽马辐射带来的异常，一边努力和纽约的蓝先生寻求解决办法。 在汽水生产厂房的他一日不小心割伤手指，让血滴入了汽水瓶，远销到美国的这瓶汽水暴露了他的行踪。美国军方穷尽能力追捕他，还找来求胜心切的英国霹雳将军Emil Blonsky。被逼到绝路的Bruce变身为绿巨人，Emil和其他军人都大吃一惊。为了亲手擒住Bruce，Emil建议给自己注入可使基因变异的样本。 Bruce在美国隐匿时遇到旧女友Betty Ross，Betty义无反顾地站在他一边，同时发现，她拥有令他体内绿巨人安稳的力量。 那边Emil已经被求胜蒙蔽了眼睛，他的寻衅加上美国军方极度想利用Bruce体内异能作为残暴行径的决心，一场大战已经避无可避。

一个平静的夏天，姆明谷爆发了大危机，火山迸发，洪水袭来。水升得越来越高，但在最后关头，姆明一家发现了一栋陌生的房子，结果这不是一个普通的房子，而是一个剧院舞台。

该剧以大革命失败到抗日战争前夕国共对峙十年为历史背景，讲述了我党地下工作者江波如何在国民党军中经过漫长的敌营生涯，历经风险、逐渐成长，为党获取大量重要情报，成为一名高级红色特工的故事。

故事发生在二十世纪四十年代初，日寇投降前夕的上海，日本驻上海的特务机关梅机关头目松田祯昭曾密藏了一份叫作"蓝色档案"的长期潜伏特务名单。为了获取这份名单，国民党中统局派遣了中统特工赵康成功打入日本特务机关梅机关内部；同时国民党军统局也派遣了军统特工银狐和寒冰从重庆赶到上海执行这项任务。中统特工赵康不惜牺牲名誉、牺牲了与沈亚奇的爱情，与松田周旋，经受重重考验，获得了松田的信任，获取不少绝密情报。军统特工银狐为了谋取私利，暗中勾结日本特务机关，出卖情报，并且不断地对中统特工暗下毒手。美国情报局对这份"蓝色档案"也垂涎三尺，特派美国中央情报特工逢天爵暗中勾结银狐，企图窃取。我党为彻底打碎敌人的反扑阴谋，迎接全国解放，指派党的地下工作者贺德彪、沈亚奇伪装成国民党中统特工，围绕着"蓝色档案"与敌人展开殊死斗争。

2006年初冬之际，中国西部某省边阳市，公安局长赵伟东勤奋精明，辖区治安平和安静。但就在主管市政建设的副市长高中信上任的第一天，在为世纪广场落成剪彩时突遭枪击，在现场负责安全的赵伟东替高副市长挡了两枪，奇怪的是子弹并不是从同一个枪膛射出的。 赵伟东命令刑警队长宋杰先从高市长查起，不巧五天后，高市长从省城赶往边阳市的高速公路上突遭车祸身亡。3·12的枪击案与事隔仅仅五天的车祸，高副市长的死因引来了众多的猜测，案情变得扑朔迷离。公安局根据枪击案现场遗留的弹壳调查发现，其中的一颗子弹十六年前黄志强所使用的，而黄志强在被包围的时候饮弹自尽。 就在案件调查没有紧张的时候，警员毕大海发现了一个手机，可警方找到机主的时候，他已经被人杀害。一时间，云山雾罩，迷雾团团……

1952年，古巴独裁者巴蒂斯塔上台，他所率领的政府在国内实行高压统治，对国外则推行亲美政策。切•格瓦拉于1955年和菲德尔•卡斯特罗在墨西哥城相会，随后加入卡斯特罗组织的“七二六运动”。次年，格瓦拉与其他81名起义者一同踏上推翻巴蒂斯塔独裁政府的征程……

该剧讲述了相识于网络的电脑工程师文丽和网名为“彩虹勇士”的于珉，因一台记录受贿官员名单的手提电脑而陷入重重险境的故事 [3]。

本季讲述了女佣之死、校园疑云、第三个女郎、死亡约会四个故事。