为了侦破棘手案件，警方往往借助线人之手获取情报。然而在行动过程中，却常常有意无意置线人于危险之地。一年前，线人废噏（廖启智 饰）的悲惨下场让香港警察李沧东（张家辉 饰）的身心备受煎熬，表面的荣迁始终洗刷不掉铭刻其心中的罪恶感。而如今，他不得不再次与新的线人合作。这次，他找到了命运多舛的小混混何细鬼（谢霆锋 饰）。为了搭救身陷水火的妹妹，何细鬼无奈接受了李沧东的任务，打入金行大盗华天（陆毅 饰）的团伙内部获取情报。在何细鬼的帮助下，警方掌握越来越多的证据，抓捕的罗网也渐渐收拢。与此同时，何细鬼的境遇也愈加危险。一年前的悲剧似乎将再次重演，李沧东该如何选择……

故事围绕两兄弟和一个难民营内的越南少女的反叛爱情关系，题材敏惑，充满戾气。刘和严的父亲任职监狱署，与妻离婚后，打算再娶女友钱慧仪，令原已反叛的儿子更反叛，以致两个儿子走向毁灭之路。

中五在读的朱婉芳（袁洁莹 饰）与郭小珍（李丽蕊 饰）本是一对儿普通的中学女生，直至帮派分子刀疤试图接近朱婉芳，在校门口殴打一名不良学生致其意外身亡。警官海哥（林正英 饰）要求朱婉芳出面作证，虽然刀疤之大哥潇洒（张耀扬 饰）恶语威胁，但朱婉芳在温老师（刘松仁 饰）与海哥的正气之下，终于指认嫌凶。潇洒将朱婉芳掳走勒索，温老师在众目睽睽之下却无力保护自己的学生。为偿还欠款，朱婉芳与郭小珍打工度日，刀疤从旁默默相助，终于婉芳留意他温柔的一面。不久郭小珍发现男友佐治背叛，伤心欲绝之际遭车祸身亡，朱婉芳的世界突然间分崩离析。

大侠齐如丰将为救他而身亡的仆人方诚的儿子方刚抚养成人后，欲立其为掌门人，此举引来方刚师兄的嫉妒。追求方刚不成的齐如丰的女儿齐佩联合师兄与方刚比武，却失手砍断方刚右臂，方刚负伤逃离齐家。只剩左臂的方刚被少女小蛮救下后一度意志消沉，但终在小蛮的鼓励下重获信心，凭借小蛮父亲留下的秘籍《左手图谱》练成“左手神刀”绝技。齐如丰的仇家笑面二郎和长臂神魔将齐的弟子悉数杀尽，并囚禁了齐佩和齐如丰。顾及师恩，方刚决意不计前嫌助齐家一力。

钟国强（张国荣 饰）是名教堂的神父，某日，白雪花（袁咏仪 饰）逃债至告解室，白雪花在底层挣扎的悲惨命运打动了神父，他决定开始挽救这群迷途羔羊的肉体和灵魂。同时，和夜总会挂钩的黑帮老大“恐龙”成为警方的目标，警察大哥刘青发（刘青云 饰）和手下（陈锦鸿 饰）打算将白雪花设为突破点，开始了对其一行人长时期的盯梢。白雪花等人在神父的悉心引导下渐渐回归正途，她们找了新工作，还开始组乐团唱歌。欣慰的神父悄悄地重返教堂，却不知随后白雪花又被迫回到“娱乐界”。神父再次出山，联手警方开展了一场营救行动！

清末，太监总管李莲英授意义和团内神打、茅山、术士三坛清除叛徒二舵主雷公（刘家良 饰）。神打坛方少卿（惠英红 饰）与师叔（刘家辉 饰），茅山坛雷勇（刘家荣 饰），术士坛铁猴（小侯 饰）、铁坛主（陈观泰 饰）分头南下广州，寻觅雷公下落。当年雷公掌管云南分舵，因不愿见弟子凭借所谓“神打”功夫抵抗洋人军火徒然丧命，不惜违背朝廷旨意，将义和团云南分舵解散，化名雨伯隐居乡间。三坛之追杀人马皆有争功之心，暗斗不止。雷勇更用无赖（傅声 饰）乔装雷公以引出真身。方少卿与铁猴先后为雷公大义感动转变阵营，但三坛坛主仍欲置雷公与死地。

叶孤红（杨千嬅 饰）生性开朗乐观，纵使历年来经历了很多倒霉事，但都让她一笑置之，更常常研究各种术法转运。 城中著名堪舆学家赖料布（梁朝伟 饰），自小便得祖训不得与姓叶的人结缘，叶孤红为了能得其指点，便想尽办法接近赖料布，二人缘分也从此开始。 赖料布算得原来一直有高人扰乱叶孤红的生活，那人便是赖料布的死对头段蟹（郑中基 饰）。要把叶孤红置之死地的是她父亲的第二任妻子。 赖料布抛开祖训，决心和叶孤红携手对付段蟹。

素芬（凌波 饰）在父亲的安排下与军人国樑（关山 饰）成婚；婚后丈夫被调往前线打仗，然家姑善妒，对芬诸多挑剔。素芬抵受不了家姑的折磨终染上肺病，家姑更乘机以肺病传染为由，迫她解除婚约。自始夫妻不能相见，直至战争完结，两人虽终有缘相遇，只可惜他们已阴阳永诀……

功高强、行侠仗义的好汉方世玉深受反清组织红花会总舵主陈家洛的青睐。然而，心狠手辣的红花会二号人物于振海，认为方世玉是他争坐总舵主之位的障碍，欲置方世主于死地。红花会会员不知总舵主是当朝皇帝乾隆的亲哥哥。居心叵测的日本浪人获得了陈家洛的“身世书”欲交乾隆皇帝。陈家洛知道，一旦身世暴露，红花会将面临分裂的危险。于是，他派方世玉拦截日本浪人。方世玉不知要夺之物的重要性，途中为救一遭劫少女而未拦截成功。不久，密探禀报陈家洛，“身世书”落入两广总督孙士毅之手，而他的女儿孙安儿正是被方世玉解救的遭劫少女。陈家洛又派方世玉用“美男计”智夺“身世书”。孙安儿早已悄悄爱上方世玉，孙士毅也知他加入了红花会。为降伏方世玉，他将计就计来个比武招婿。身手不凡的方世玉将美人孙安儿轻取怀中，痴情的孙安儿明知方世玉不是为她而来，仍真心成全了她的心上人。方世玉打开“身世书”顿时明白了一切。他争忙打道回府，却被官兵团团围住，幸得孙安儿挺身相救转危为安。方世玉对陈家洛身世守口如瓶，谎称未取到，奸诈的于振海逼陈家洛新手废掉方世玉的武功，受重伤的方世玉被母亲和师兄带回茅舍养伤。于振海则以阴谋手段绑架了陈家洛，爬上了总舵主的交椅。他断定方世玉知道陈家洛的身世，为巩固自己的地位，于振海决定带兵追杀世玉。师兄为掩护方世玉被杀，方的母亲也被于抓获。为救母亲，方世玉忍痛杀回红花会与于振海决战。于振海万没料到方世玉的武功并没被废掉，恶贯满盈的于振海终于死在方世玉的手下。陈家洛重新掌权，力邀方世玉共创大业。方世玉却毅然退出江湖，和母亲、未婚妻一起回乡隐居。

闻风丧胆的七煞会，再次集结各个分坛主，江湖将掀起血雨腥风。