故事发生在未来世界之中，在那里，怪盗和侦探是两个同样活跃但相互对立的群体，长久以来，两个群体之间一直维系着相互制约和对抗的微妙平衡。在这样一个动荡的时代中，有一些人拥有着名为“Toys”的特殊能力，拥有这种特殊能力的人们有着比平常人更为缜密的逻辑思维和敏锐的观察能力。天真烂漫活泼可爱的雪莉福德、成熟冷静充满了高贵而优雅的气质的阿蒂尼亚、性格内向沉默寡言十分喜欢读书的艾露克露和个性大大咧咧心直口快的让崎妮洛，这四名拥有特殊能力的少女们展开了和怪盗之间的争斗。

自赛文奥特曼的儿子赛罗奥特曼登场以来，如今迎来了赛罗奥特曼10周年。被称作亲子英雄的赛罗奥特曼一直享有超高的人气！ 本次将会播放很多有关赛罗奥特曼的出场作品，让我们再次领略下赛罗奥特曼英勇的身姿吧！赛罗奥特曼曾经遇到过的各种强敌都会再次出现，而赛罗奥特曼将会把他们一一打败。 另外，捷德奥特曼也将会出现在这次的作品里。捷德奥特曼的人类形态小陆，他的成长经历也是十分的艰辛与坎坷，从小无父无母，生活全靠打工维持生计。不过，小陆还有伙伴们，是伙伴们的笑容，让小陆成长了起来。 只不过捷德奥特曼是邪恶奥特战士贝利亚的儿子，而贝利亚又是赛罗奥特曼的宿敌。捷德奥特曼和赛罗奥特曼相遇将会发生怎样的故事呢？捷德奥特曼与贝利亚之间又有什么不为人知的秘密？

为了阻止企图霸占世界的黑暗势力，野原家的普通小狗——小白接肩负重大使命，变身成为了守护世界的“超级小白”。小白将要面对的不仅是发明狗，还有其他意想不到的对手。当然，面对邪恶势力，小白也有着令人惊讶的超能力。于是，在这样一个以动物为主体的世界里，一场守护世界和平的“大战”悄然展开了。

柯南和小五郎等拉着大队，来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”度假。这座岛屿自古流传着关于沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底宫殿”附近潜水时，意外遇到一大群正在寻找宝物的猎人，不料其中一人突然遭鲨鱼攻击，不幸身亡！小兰和园子幸运逃难，柯南见那位猎人死状诡异，与灰原一起展开调查。 柯南认为猎人之死，跟宝藏传说有着很大的关系，他试图解开背后原因，“海底宫殿”的谜题一直系绕在他的脑海中。他找到了一组神秘名词“Jolly Roger”后，猎人却突然现身，并偷走了原来发现的宝藏！小兰和园子落在猎人的魔掌之中，性命危在旦夕！隐藏于传说中的讯息是什么？“海底宫殿”有什么秘密？穿越300年时光的暗号，柯南誓要逐步解开谜题。

少年时代，南波兄弟意外在夜空中目击了那如梦如幻的UFO，这次经历在他们幼小的心中埋下了航空梦的种子，他们相约朝着宇航员的目标努力，携手登上月球表面。此去经年，南波日日人率先实现了兄弟俩的梦想，另一方面，日日人的哥哥南波六太正走着一条全然不同的道路。他少言寡语，全无干劲，而就在他最低落的时刻，一个久违的词汇突然在他的脑海中浮现。

第三季的内容主要为当世界各国逐渐走向平稳之时，小史马隆的少年王撒拉列里为了支配世界而开始刻意接近有利。萨拉雷基一面试图以奇异的力量控制有利，一面使着诡计企图离间真魔国一行人。面对这样的萨拉雷基，有利却仍希望能使他敞开心扉……

著名的高中生侦探工藤新一收到了来自世界知名建筑家——森谷教授的请帖，森谷教授打算在自己的宅邸中举办一场晚会，他邀请工藤新一前来赴宴。江户川柯南、毛利兰和毛利小五郎代替新一应邀出席。与此同时，城市内发生了塑胶炸弹大量失窃的案件。那个自称犯人的男子打来预告电话，与江户川柯南展开了博弈。犯人再次打来电话，并说到：“工藤为什么没来！”随后，凶手连续发来炸弹预告。炸弹究竟被安装在了什么地方？城市内的人们陷入了恐慌。 就在江户川柯南绞尽脑汁查找炸弹所在之处时，毛利兰前去百货商店购买要送给工藤新一的礼物。万万没想到，那栋百货商店内就被安装了炸弹！江户川柯南奋力前去救毛利兰，在炸弹即将爆炸之际，负责剪炸弹线的毛利兰选择剪蓝色的线，成功阻止了炸弹爆炸。

某天，毛利侦探事务所接到了知名舞台剧女演员牧树里的委托。委托内容是牧树里收到怪盗基德预告信，信中指出怪盗基德将在舞台上夺取牧树里佩带的蓝宝石戒指“命运的宝石”。于是毛利小五郎接受保护宝石的工作，依据毛利小五郎的推理，基德将在演出的最后一天前来盗取这颗无价的宝石。在演出的最后一天，毛利小五郎、小兰和柯南受邀观赏舞台剧，在剧场里错综复杂的人群中，基德到底会假扮成谁出现在大家面前，在紧张的埋伏等候中，出现在大家面前的竟然是工藤新一，柯南一方面必须保护宝石，另一方面又不能拆穿基德假扮的工藤新一，因为拆穿基德就等于公开自己身体缩小的秘密。柯南只好盯紧假的工藤新一，一刻都不能松懈。就在舞台剧即将落幕之前，柯南发现假的工藤新一不见了，随即追上，但却在一片混乱之中让基德逃脱了。不过，“命运的宝石”终究是保护住了，牧树里为了表示感谢，邀请毛利侦探前往北海道函馆的别墅度假，同行的还有一同演出的其他演员。就在大家都搭上飞机前往函馆的机舱时，一幕精心设计的杀人剧就在大家面前上演了。柯南除了要防止基德再度混入人群中，又要解开发生在飞机上的密室杀人事件，到底柯南要怎么行动呢？

在不久之前，市内发生了连环杀人事件，遇害人每一个都是音乐家，而且他们均出身于著名钢琴家领衔创建的一所音乐学院。江户川柯南、毛利小五郎、毛利兰、少年侦探团等一行人，收到了一位著名钢琴家的邀请，出席由他出资建造的音乐厅的落成典礼音乐会。该音乐会最大的亮点是巴赫弹奏过的管风琴、世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色，以及拥有绝对音感的天才歌手的歌声。可是万万没想到，在音乐会正式举办之前，陆续发生了许多可疑的案件，让每个人都忧心忡忡。而且，在音乐会正式开演当天，江户川柯南他们所在的音乐会会场突然发生了很大的爆炸，整个会场陷入一片火海之中。江户川柯南根据线索一步步地查明了几起案件的联系，并在最后找出了案件背后的真凶。

一天名侦探毛利小五郎收到了一张寄给他的请帖，里面是一个神秘男子的委托，神秘男子邀请毛利小五郎等人前往横滨的一个游乐场。小五郎和江户川柯南一行人快乐地来到游乐场游玩，还带上了可以出入无阻的VIP手表。不料他们却中了那名神秘男子的圈套。所有带上手表的人不得离开游乐场，否则手表上的炸弹便会发生爆炸。从现在开始到晚上十点，如果柯南和小五郎不能解开谜题，小兰和少年侦探团也会随着游乐园一起粉身碎骨。其他侦探们与柯南一同挑战谜题，当所有人一起努力调查犯人的真面目时，危机却不断展露在眼前，时间一分一秒地逼近，犯人无赖地设下了最后一道陷阱。然而更意想不到的是，那名神秘男子居然直接称呼柯南为工藤新一，这到底是怎么一回事？