大雄因为搞砸了科幻片的拍摄被小夫与胖虎责骂，于是哆啦A梦拿出道具让大雄自己拍电影，在拍摄过程中静香的兔子玩偶失踪了，后来在大雄家被发现，晚上哆啦A梦以为有老鼠而大吵大闹，结果意外发现巴比逃到大雄家来。听过巴比的讲述后，大雄与哆啦A梦决定帮助巴比，也找来小夫、胖虎与静香协助，然而PCIA得知了情报趁著大雄他们外出的空档抓走静香做为人质，要巴比自身来交换，并且带走缩小灯让大雄等人无法恢复原状，不顾大家的反对巴比秘密离开让自己被抓走换回静香。当大家知道巴比将会被送回星球审判然后处死时，便搭上巴比的太空船前往匹里卡星，途中遭遇PCIA的攻击而找到位在行星环上的自由同盟基地，大雄跟哆啦A梦与胖虎为了联络星球上的反抗组织搭乘遥控战车潜入匹里卡星。不幸地一切行动都被PCIA得知，大雄三人与反抗组织被抓住，自由同盟基地也遭到攻击。在一切混乱的当下小夫感到非常害怕而躲了起来，但是静香决定前去救援大雄等人，小夫被静香的勇气感动也驾驶战车跟随，当两人到达星球时巴比、大雄等人正要被枪决，这个时候静香两人的战车被PCIA击中落海，正当一切危急时缩小灯的效用失去，让大雄等人恢复原状得以救走巴比……

大雄在睡梦中通过粉红色的雾走进一个动物王国，里面人人和平相处，科技发达，是真正的乌托邦！原来动物王国是在遥远的星球，而粉红色之雾是来自未来世界的随意气，是可以用来通往遥远的地方！哆啦A梦回到地球后，收到未来动物星球的求救消息，但随意气已经用完，他们该怎么办呢？ 　在这个绿色的动物星球上，都是些爱好和平的动物们。但和动物星的平行星中，却住着贪婪的人类。于是战争又开始了……

现实世界里的大雄一事无成，利用哆啦A梦的造梦机，在梦境世界却成为英雄剑士，与妖怪军团作战，但是梦境渐渐与现实交错，发生不可思议的事情。 大雄使用了哆啦A梦的任意选择梦境机套装，并配上“梦幻三剑士”的盒带，把他带进了一个超真实的梦幻世界，在梦之国当中--犹美伦国正被妖灵大帝侵略。而大雄为救静香公主并与她结婚，决定起肩负打倒妖灵大帝柯多来武的重任。 到底得到白银之剑而变身成白银剑士的大雄，与好友小夫、胖虎、静香及变身成魔法师的哆啦A梦在梦境中会遇到什么困难呢……

骨川小夫拿出现在畅销的神秘火车的车票炫耀。刚田武，源静香也想乘火车，恳求小夫也带他去。这时，大雄跑来，说哆啦A梦3天也没有回家。小夫和胖虎之后也去了找哆啦A梦，大雄只顾找哆啦A梦，连晚餐也不吃。哆啦A梦回来后，说他到了22世纪买银河列车的车票。哆啦A梦他们乘搭银河列车到银河各个星群游览，另一边，神秘的生命体正悄悄来袭……

罗布鲁在超越时空时发生事故，飞船的门与大雄房间的塌塌米连接在一起。从此旷野星成为大雄的第二游乐场。大雄与罗布鲁们度过了愉快的时光。但是卡尔泰矿业公司为获得矿藏不断威胁星球上居民的安全…

大雄与同学们为了暑假作业到图书馆去找有关海的资料，无意中看见《宝岛》这本书籍后感到对寻宝一事的憧憬，于是由哆啦A梦的道具“寻宝地图”中无意刺探到金银岛，于是与哆啦A梦就怂恿胖虎、小夫与静香一起加入这个冒险，向金银岛出发。到达岛上后为了增加气氛，于是由哆啦A梦拿出“传说复原机”来增添冒险气氛。但不知道为何忽然引起时空的异变，时空错乱将他们转移到17世纪的加勒比海上，并且卷入海盗之间的斗争，不但大雄与大家失散了，哆啦A梦还甚至遗失了四次元口袋。而大雄在混乱之中被粉红色海豚“露菲”给救到岛上，并且结识了单独在岛上生活的少年“杰克”。另一方面，哆啦A梦们被当代横跨七个海域的海盗“吉特船长”与其朋友“科尔特船长”的女儿“贝蒂”解救，并且还得到他们的帮助一同前往传说中的宝岛去救大雄。后来还发现原来金银岛是未来世界“科隆博士”与“卡修”等人的秘密基地，在金银岛上将生物改造成凶暴特性来贩卖的恶人集团。哆啦A梦们是否能顺利的与大雄会合？他们是否能够阻止卡修这个犯罪集团的计划呢？

暑假将到，大家为露营地点的事而争执。大雄和静香想去海滩，胖虎和小夫则想去爬山。最后在哆啦A梦的建议下决定去海底山。去海底露营的大雄等遇到了海底人，并且由于海底火山活动的影响，得知亚特兰提斯预备发射鬼角弹的事，如果亚特兰提斯发射鬼角弹，那么全世界都会毁灭，因此为了阻止鬼角弹发射，大雄他们决定去亚特兰提斯的百慕大海域阻止这个阴谋。

暑假的自由研究进行不下去的大雄，用哆啦A梦的秘密道具“创世组件”开辟新的宇宙，观察地球型行星的历史。在诞生了人类之中，有个与大雄长相非常像的人。大雄对自己的祖先提供援助，成为那个世界的神秘力量。到了现代后，野比野美秀和出木松，源静代等向南极进发。并且看到了在地下世界的昆虫文明。原来，在新的地球里本来应该发展的是昆虫文明。到底新世界的命运的将何去何从……

小夫炫耀自己家的暴龙趾骨化石。大雄眼红并信口开河表要找大整架恐龙化石，否则便用鼻子吃意大利粉。于是，他便前往图书馆借了些有关恐龙化石的书籍。后来他在附近的断层挖到一枚恐龙蛋的化石，并以时光布还原之后得到一只双叶颈龙，并以叫声将之命名为“皮助”。很快大雄和它成为好朋友，但因它越长越大且被人发现，故大雄决定将他送回白垩纪时代。可是，后来却发现将它错送到上古的北美洲。于是，大雄一行人乘时光机再次回到恐龙时代，但途中被欲抢皮助的神秘人追击，时光机因而故障，使大家必须靠自己沿着古陆块回到日本。 经过长时间的冒险，神秘人物再度出现希望获得皮助，原来是未来的违法恐龙猎人，要获得皮助卖钱，要大雄一行以交出皮助为条件，换取将他们用时光机送回家。大雄最后决定则想办法夺取时光机，但途中被发现而使静香、小夫、胖虎被抓，哆啦A梦和大雄赶往援救却进入陷阱，他们被放在基地中的恐龙竞技场中，恐龙猎人放出恐龙，在可能被吃的千钧一发下，原来该恐龙是吃过桃太郎饭团的恐龙，因此在恐龙的协助下反败为胜，又配合赶到的时光巡逻队打败了恐龙猎人。最后在时光巡逻队的帮助下，将皮助带回它的故乡，可皮助对大雄万分不舍，……

大雄有一天相救并收养一只差点溺水的狗，取名为“阿一”。某日，大雄和哆啦A梦还有静香为了不让妈妈知道大雄收养狗而用任意门逃到后山，并发现后山大量被遗弃的猫狗，于是连同胖虎和小夫一起带了许多的野猫野狗坐时光机回到还未有任何人类存在的三亿年前（石炭纪晚期）的地球建立猫狗王国。大雄使用了“进化退化放射线枪”将阿一进化成像人类一样，使其能够听得懂人类的话。当日傍晚，当大雄要回到二十一世纪时，答应阿一明天一定会再来，并在上时光机时，不小心将剑玉的球掉落在那里，被阿一捡起。翌日，大雄等人在返回三亿前的途中遇上时间扭曲，被带到三亿年前的一千年后，那里竟是繁华的猫狗都市。大雄发现，因为把进化退化放射线枪遗留在三亿年前，让猫狗们的科技变得这么发达。在这里，大雄遇上一只貌似阿一的狗——小八，小八跟友伴向大家倾诉，原来小八等人的父母去了查路猫乐园后都不知所终，大家决定到查路猫乐园调查。