主角工藤新一原本是一位颇具名声的高中生侦探，在目击黑暗组织的地下交易后，正准备追踪时却被突袭击昏，并被灌下代号为“APTX4869”的不明药物。后来虽然幸免于死，但身体就此缩小为小学时期的模样。之后他化名为江户川柯南，在邻居阿笠博士的建议下，寄住在女友毛利兰的父亲—侦探毛利小五郎家中，继续秘密从事追查黑暗组织的工作，并私下探寻获得解药的管道，希望能够恢复原来新一的样貌。与此同时，柯南凭着自己的推理天份，配合阿笠博士为他发明的道具，帮助毛利小五郎成为出名的大侦探。故事内容当中穿插许多爱情、友情、犯罪、背叛、复仇等情节。

气血值

为了找回珍视的伙伴，伍六七重回玄武国，面对那些被遗忘的记忆碎片。尘封的真相带来痛苦与愤怒，但现在的他不再是孤身一人。拥有力量，究竟是为了什么？这一次，伍六七要为自己的人生做出新的选择…

穿越到武者世界

西元2191年，地球人类于史上首次与地球外智慧生命体接触，两者之间并引发战端。对方名为“卡米拉斯”。在拥有压倒性军事力量的卡米拉斯攻击下，地球防卫舰队即将溃灭，且由于卡米拉斯冥王星基地发射的游星炸弹对地球不断轰炸，将人类逼进地下都市，大地一片枯竭，大气遭到污染，地下都市中则因能源不足、饥饿、暴动等状况将人类逼入绝境。并且覆盖地表的污染亦往地下都市侵蚀。 2198年，地球接收了来自异星人行星“伊斯坎达尔”的“次元波动引擎”技术供应，并开启了恒星间航行用宇宙战舰“大和”号的建造计划。 2199年1月，经科学家估计后得出，人类距离灭绝只剩下一年的时间。冲田十三提督所率的联合国宇宙军第一舰队，在冥王星宙域开始了“メ号作战”。这场战斗中，有一艘暗号代码为“天照”（アマテラス）的宇宙船飞入太阳系。于火星等待“天照”的古代进与岛大介，将坠落宇宙船中的座舱回收，并由撤退的宇宙战舰 雾岛号 收容回到地球。 回到地球，于“天照”计划中回收的“波动核心”被装进“大和”号，成为主要能源核心。古代等人均以遴选乘员身分受到召集。虽然他们估计受到召集是因为要启动宇宙移民计划“出云计划”（イズモ计……

以现代的日本（浮世绘町）作为舞台，描绘了人和妖怪的日常的怪异空想，继承百鬼夜行大头领的少年在妖怪百鬼夜行的世界中劝善惩恶的故事 。 故事中的妖怪，大部份是出自鸟山石燕的“画图百鬼夜行”和竹原春泉的“小人儿书一百故事”的妖怪画集。 作者曾表示，创作时最喜欢听台湾的闪灵乐团，作品灵感也受到该乐团影响。

贝琉连公司在战时开发的新技术“身体机能扩张技术”。 通过那种技术将自身的一部分或者全部机械化的人被称为扩张者（Extend）。 扩张者和肉身人类的非扩张者混杂的社会纠纷不断，乾十三以解决这类问题的“处理屋”为职业谋生。 并且，十三自己也是一名头部是巨大的枪的“扩张者”。 有一天，十三被一名全身扩张者的大汉委托，要求保护一位少年。这位少年的名字叫荒吐铁朗，是从贝琉连公司诱拐出来的。但是，十三虽然接受了委托，但铁朗还是被贝琉连夺回。十三与掌控城市的贝琉连公司间的纷争由此展开…… 诱拐铁朗的男性全身扩张者是什么人？ 贝琉连公司和铁朗又有什么关系？

我的名字是乾十三。经过那场大战后，这座城市满是身体机能受过扩张处理， 被称为「扩张者」的人们。我在这里以「处理」与扩张者相关问题的工作作为生计—— 一名男子造访了十三——头部为枪的扩张者——的事务所。 被视为绑架犯而受到警备局追捕的这名男子， 委托十三保护他所绑架的一名小孩。十三究竟会决定怎么做？ 由飘荡硝烟味的枪口所道出的科幻硬汉动画在此开幕！！

在“超高校级的绝望”带来的“人类史上最大最恶的绝望事件”之下，世界陷入了濒临崩坏的绝境。为了拯救这个充满绝望的世界，“未来机关”结成了。打倒了江之岛盾子的苗木诚等78期生，加入了未来机关。他们在此继续复兴世界的活动，但苗木却被问以庇护“绝望的残党”这一叛逆之罪。未来机关众人为了苗木的处分而聚集在一起，却遭到黑白熊的监禁，并被要求进行“最后的自相残杀”。手臂被戴上了奇妙的手环，过了一定时间就会被投以安眠药。不止如此，这其中还存在着“背叛者”，是为了杀掉未来机关而来的。“为了生存下去，非得找出背叛者并杀掉不可”。不存在“学级裁判”这一规则的自相残杀。杀或者被杀，在这极限状态的死亡游戏中，苗木等人被逼入绝境。希望杀死希望的绝望物语开始了。

太平洋上的美丽小岛——神海岛。传说，在很久以前那里的海底就存在着古代遗迹“海底宫殿”，并且300年前真实存在过的两名女海盗“安娜·波尼”和“玛丽·里德”曾在那里遗留了大量的宝藏。 今次的故事就从这神秘的小岛开始，在小五郎的带领下，柯南一行人前往位于太平洋上的小岛“神海岛”上享受愉快的假日，蔚蓝色的大海和无限的自然风光加上自古以来流传的两个“神 海岛”传说让这个小岛成为游客成群的度假圣地。兰和园子在“海底宫殿”附近的海域享受有氧潜水，少年侦探团则玩起了神海岛观光课安排的寻宝游戏。然而，觑意于传说中的财宝的宝藏猎人们也潜入了这个迷人的小岛上。兰和园子意外的遭遇到一名被鲨鱼群袭击的宝藏猎人，猎人的死是因为传说中的宝藏吗？急忙赶来的柯南发现了死亡的疑点，并和灰原一起展开了调查。