文伽是一位身着日本旧式邮政工作制服、手持不可思议手杖的无口少女，在她黑色的工作包中装满了贴着黑色邮票的信件。那并不是普通的信，而是已经过世了的人写给重要的人的信——死后文。少女与作为同伴的手杖“卡娜卡”一起往返于冥界与生界，传递跨越了生死的依恋。

在日本国内居指可数的学校法人“汐美学园”不仅拥有众多学生宿舍、各种运动设施，还提供了餐厅甚至电车等资源，其中以规模仅次于国家图书馆的“大图书馆”最为引人注目。“图书社”的成员笕京太郎，经常一个人在大图书馆中悠闲地读书。 4月，从“不论什么样的愿望都能实现”的谜之牧羊人那里，收到了写着“今天，会有改变你的命运的事件吧”的邮件的笕，认识了白崎鸫。“为了让学园变得更快乐”而活动的鸫，和她的朋友樱庭玉藻、以及笕的朋友一起加入了图书社。之后，两位少女铃木佳奈与御园千莉也加入了。六个人都收到了牧羊人发的相同邮件。 以Cosplay的方式分发传单而提升了知名度的图书社收到了众多的委托，同时也收到了图书委员的小太刀凪的警告，。图书社虽然在活动的同时追查著关于牧羊人的谜团，但只有京太郎发现了其真实身分。 接着到了7月。经过图书社的活动，笕与成员们分担烦恼，有了更深入的接触。

故事的舞台是离今稍微远点的未来。\r\n世界上正流行这一种感染后在60天之内就会石化，死亡率高达100%的奇病“美杜莎”。为了在未来寻求这种在全世界爆发的不治之症的治疗方法，于是决定将Cold sleep（冷冻睡眠，简称CS，是指将人体保存在低温状态让人保持沉睡的状态，防止人的身体随着时间老化的一种方法。多见于SF作品之中。）投入使用了。少女霞从众多的人中脱颖而出成为了世界上仅有的160个拥有CS资格的人。他们在苏格兰的古城中制造出来的Cold sleep capsule center（冷冻睡眠胶囊中心，简称CSCC，如字面上的意思进行冷冻睡眠的地方。）中进入了不知道何时才会醒来的长眠。霞想着肯定再也无法与和自己同样感染了“美杜莎”却没有被选上的双胞胎姐姐见面了，眼泪不禁的流落了下来。\r\n但是寻求未来的长眠却被突然中断了。出现在觉醒后的霞面前的是已经面目全非的冷冻胶囊中心。宛如童话《睡美人》中的城堡一样，整个中心都被蔷薇覆盖着。但是现状却不那么美好，异形的怪物们袭击了过来，资格者们不断的死去。为什么会有怪物？那之后究竟过了多少年？几十年？几百年？外界的情况又怎么样了呢？美杜莎的治疗方法呢？在所有情报都被遮断的极限状况下，为了生存下去霞等7个资格者开始逃离中心了。

“十八岁。高中最后一年。明明如此，六花却……仍然是个中二病”。升入大学的考试近在眼前，高中三年级到来前的春假。 富㭴勇太和小鸟游六花的共同生活依然一成不变。但他们的上位契约似乎仍未缔结……这样的某一天，六花的姐姐十花宣言要将六花带去意大利。她说自己的工作已经安定下来，因此要携家迁居。勇太虽然感到焦躁，但十花却提出了「不能就这么放着考大学也很危险的六花不管」这样的合理意见。这样下去的话，两人就要被迫分开。担心他们的丹生谷等一如往常的成员，对勇太提出了逃跑的提案。 就这样，以日本全国为舞台，两人的逃亡剧就此展开。