《头文字D》的第二部着重突出拓海的成长，当然不乏激烈的挑战。最经典的要数赤诚和依吕波山路两位老大的比拼。年轻的拓海在爱情上触了礁，在输给帝王车队的lanEvo 3后，拓海遇到了人生的挫折，对自己和AE86产生了怀疑，AE86真的有足够的实力吗？AE86的重生来自拓海的爸爸文太，他为AE86改装了车用引擎。同时，拓海遇到了同样是AE86的强劲对手秋山涉。有意思的是比赛规则是在同一赛道两车来回追赶，直到其中之一能超越对方为止，既要技术又考耐力。胜利让拓海继续接受这辆AE86和重拾信心回到车手的生涯。

故事的主角是一个叫帕希菲卡的女孩。她是莱因布安(莱邦)王国被遗弃的公主。第5111个圣格林德预言说她是“毁灭世界的猛毒”，时间是当她满16周岁时。因为这样，当帕希菲卡还是婴儿时就被人从山崖上丢弃。直到她15岁时，无人知道她依然还活着。帕希菲卡被一位巫师所救并且被卡斯尔家族收养。卡斯尔(卡苏鲁)家族的长男和长女夏浓及拉克维尔更成为了她的保护者。夏浓是一位剑客，拉克维尔(拉寇儿)是位魔法师。他们的能力都很强。在整个故事中，他们一直跟着帕希菲卡，保护她免于遭到那些害怕预言结果的人杀害。另一方面，帕希菲卡却没有什么能力可以保护自己。随着故事的发展，预言的真相渐渐地浮上了水面。帕希菲卡将要毁灭世界的说法好像是谎言，而帕希菲卡则必须意识到她潜在的命运。原来自从5000年前以来，人类世界就一直受秩序守护者所控制。人类文明也被局限在中世纪的发展阶段。而帕希菲卡是唯一一个可以改变这个局面的人。因此帕希菲卡被称为律法破坏者，这才是她被追杀的根本原因。

在科学与魔法共存的世界树不子里，存在着人类、兽人、动物，以及被称作戮兽的怪物。戮兽威胁着人类的生活，但人类也同样有猎人与其作战，保卫着世界的和平。露比在培养猎人的学校信标学院里，同魏丝、布蕾克，以及自己的姐姐阳组成了「红玉队」。她们怀着各自的想法，为了成为猎人而努力训练。等待着她们的，是前所未有的新威胁——

刚加入点心制造公司，在经营部认真工作的30岁左右男性——立石真直， 与在企划部工作的要强女同事——三谷结衣。 两人性格截然相反，常被周围人认为是“水火不容”的冤家， 但事实上，他们早已被彼此吸引……？！ 严格保密的 纯洁职场恋爱故事，正式开幕！

数千年后的未来，进入宇宙空间的人类，被分为银河帝国与自由行星同盟这两个拥有“专制政治”与“民主主义”两种不同政治体制的国家。两国之间的抗争持续了150年，以无边无际的广袤银河为舞台，重复着无止境的战斗。银河帝国的门阀贵族社会的腐败，以及在自由行星同盟中被称为“民主主义的弊端”的群愚政治正侵蚀着两个国家。之后，宇宙历8世纪末，两位天才的登场驱动了历史。“常胜的天才”莱因哈特·冯·罗严克拉姆，以及人称“不败的魔术师”的杨威利。两人率领着帝国军与同盟军，展开了不知道是第几次的冲突。

令世间万物为之恐惧的魔王被击败， 在这个时代，人们再也不必担心灭亡。 在能够对未来抱有幻想的今天、 少女被卷入了蛮横的暴力纠纷中。 美丽的景色已荡然无存，城市和花草树木都陷入火海。 耳边伴随着活生生被解体的挚友悲痛的临终哀嚎， 少女逃出生天。 最令人绝望的事情， 莫过于至亲之人逝去之时，自己仅能袖手旁观。 然而，少女面前出现了一位剑士。 他仅用一击便轻松斩断了这份绝望以及少女无法抗衡的那份蛮横。 “本大爷叫柳生宗次郎，是这地球上最后的柳生后裔。” 在这世界上有这样一群人， 他们站在各个力量的顶点之上，并冠以“最强”之名。 剑士也是这世上数不尽的“修罗”之一。 在魔王不复存在的这个世界，仍在追求战斗的“修罗”不计其数， 而剑士只不过是其中之一。 ——这样啊，我无法原谅他，无法原谅所谓的强者啊。 尽管多次在他的帮助下保住性命，但少女的心中却涌现出了错误的情感。 然而对于失去了一切的少女来说， 她需要一个足以支撑自身前行的理由。 ——杀了他。在这世上，有能够葬送他的强者。 凭借对不合理的“强者”们的仇恨， 少女与剑士一同踏上旅途。 消灭“最强者”的旅途就此展开。

舞台为2030年的东京。东京近郊一带突然观测到了高频共鸣音，同时城市也被红雾给包围。 接着，听到那个声音后无论是动物还是人都会失去意识。随着首都功能的麻痹，政府暂时转移到大阪，并推测引起该现象的罪魁祸首应该是不明真身的病毒，进一步担心此为流行性病毒，于是封锁了东京。但是，自这个“大共鸣”6天后，失去意识的人们像什么事都没发生一样地醒了。 之后，封锁都市·东京逐渐恢复了作为城市的功能，但以那天为界，各种“异常事件”开始发生，人们相继地被进一步被非日常给侵蚀。 其中，解放隐藏在血中的力量的年轻人们，朝着“英血之器”觉醒—— 他们被彼此的力量所吸引，不容分说地相遇，心灵相通，相互收割性命，逐渐被残酷命运的环链给吞噬。

在武士统治日本的时代…… 维持京都治安的新选组被杂面之鬼全灭，仅一人幸存。 于是，七个罪犯被选为了新选组的替身。 同样被杂面之鬼杀死父母的一番星，作为局长·近藤勇的替身，一边担当替身们的中心人物，一边追查仇敌。 曾经的罪犯挺身而出，在喧闹中匡正世道的故事即将开幕！

荒木哲郎 × 虚渊玄 × 小畑健 世界瞩目，让日本自豪的最强创作者展开合作！ 在重力已然崩溃的东京，少年与少女的心在互相吸引—— 因为倾泻于全世界的泡泡， 东京的重力崩溃了。 失去了供给的东京， 被失去家人，无家可归的年轻人们当成了游乐园， 他们还在此展开了于建筑之间纵横跳跃的团体跑酷比赛。 其中有一个队伍的王牌选手“响”，以其极为危险的动作引人注目， 但在某一天，他因为自己那超脱常规的动作而落入了重力紊乱的海中。 而一个有着不可思议力量的少女“歌”突然出现，救下了他的性命。 只有他们两人，能听到一种特殊的声音…… 歌为什么会出现在响的面前呢？ 两人的邂逅，将会带来改变世界的真相。

白鸟尊，拥有天才的观察能力，以羽毛球选手身份打拼。 然而因为全国高中生大赛时留下的心理阴影，他一直打不出自己理想的状态。 最终，他以业余选手身份效力的强队：三穗银行队开除了他。 为了能以选手身份东山再起，他加入了阳光饮品公司。然而等待他的却是陌生的职员工作，以及一个尚未打出成绩的弱小羽球部。 不仅如此，他还遇到了一个粗鲁、大嗓门还特别自来熟的大叔：宫澄建 曾为天才、现为社会新人，遇上豪爽大叔「羽球白领」。 当一切都截然相反的两人结成搭档， 濒临放弃的梦想，再一次拉开了帷幕。